RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 RAB26Q9ULW5 256 aa2.07□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 RAB5BP61020 215 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00483Q53H64 154 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 PP632Q6XCG6 107 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM167BQ9NRX6 74 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 H7C2G1 150 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 ERC2-IT1O76042 136 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 CXorf1O96002 111 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 MT1BP07438 61 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 GIPP09681 153 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 RPL39P62891 51 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 Q8NDZ9 215 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.05□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 SIX6O95475 246 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 IFNA1P01562 189 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 FCER1GP30273 86 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 AKR1C3P42330 323 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 AP3S2P59780 193 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 PYDC2Q56P42 97 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 AKAP14Q86UN6 197 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 BAGE2Q86Y30 109 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 LIMD2Q9BT23 127 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 ST20Q9HBF5 79 aa2.04□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0G2JQZ4 141 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 RAB19A4D1S5 217 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF726P1Q15940 193 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf195Q5TG92 126 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 DEDD2Q8WXF8 326 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 HSPB11Q9Y547 144 aa2.03□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC160A6NGH7 325 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 F2Z2F3 143 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 F8VRH5 84 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 SMKR1H3BMG3 65 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 RAB5AP20339 215 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 ATP6V0CP27449 155 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 RAB14P61106 215 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 C6orf99Q4VX62 202 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 STOML3Q8TAV4 291 aa2.02□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 TEX46H3BTG2 121 aa2.01□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 HBBP68871 147 aa2.01□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 Q8IZM0 81 aa2.01□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.01□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 A8MWL6 223 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 A8MWP4 228 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 TEX261Q6UWH6 196 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 ARL17AQ8IVW1 177 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf62Q8N4C0 152 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 FAM210AQ96ND0 272 aa2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 PFN2P35080 140 aa1.99□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 CXCL5P42830 114 aa1.99□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 SMAGPQ0VAQ4 97 aa1.99□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 V9GYH0 126 aa1.99□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 HRES1P13985 223 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 MT4P47944 62 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 NMUP48645 174 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM15Q7Z3B0 74 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 Q9BRP9 147 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 CNFNQ9BYD5 112 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 VCX3BQ9H321 246 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa1.98□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GV50 99 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 NAP1L6A6NFF2 107 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 MBP02144 154 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 RPL35P42766 123 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 Q5VV11 94 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 TEX43Q6ZNM6 134 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 PCP2Q8IVA1 136 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 VCX3AQ9NNX9 186 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 SPANXA1Q9NS26 97 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 TNFSF18Q9UNG2 199 aa1.97□□□□□ -2.09
TMOD3-210ENST00000561408 A0A087WXM4 84 aa1.96□□□□□ -2.1
TMOD3-210ENST00000561408 S100A9P06702 114 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
TMOD3-210ENST00000561408 RAB4AP20338 218 aa1.96□□□□□ -2.1
TMOD3-210ENST00000561408 CENPWQ5EE01 88 aa1.96□□□□□ -2.1
TMOD3-210ENST00000561408 C10orf91Q5T1B1 145 aa1.96□□□□□ -2.1
TMOD3-210ENST00000561408 AMN1Q8IY45 258 aa1.96□□□□□ -2.1
TMOD3-210ENST00000561408 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa1.96□□□□□ -2.1
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