RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 C12orf57Q99622 126 aa-0.71□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 MANBALQ9NQG1 85 aa-0.71□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.71□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.71□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.71□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 FAM223BA6NKX1 122 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 ARPC4P59998 168 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 GNG11P61952 73 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 GNGT1P63211 74 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 CATR1Q13166 79 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 LELP1Q5T871 98 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.72□□□□□ -2.52
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.72□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.72□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 BPTFQ12830 3046 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0G2JND7 137 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 H3BQF6 201 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 FGF7P21781 194 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DR1Q01658 176 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 NMSQ5H8A3 153 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SCN7AQ01118 1682 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 NAIPQ13075 1403 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ITPR2Q14571 2701 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRL2O95490 1459 aa-0.73□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 TRIOO75962 3097 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087WVE0 104 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB1P60022 68 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 Q0VG73 95 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 H0Y9P7 68 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 H7BZZ5 65 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 S4R3F8 94 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 PHLPP1O60346 1717 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 CEP152O94986 1710 aa-0.75□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 H0YAA0 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SELENOWP63302 87 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ABCC5O15440 1437 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 A2ML1A8K2U0 1454 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 TOP2BQ02880 1626 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SHROOM2Q13796 1616 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.76□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ALKQ9UM73 1620 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM262E9PQX1 116 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 CGREF1Q99674 301 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00470Q9BZP3 86 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.77□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 MBD5Q9P267 1494 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SCAPERQ9BY12 1400 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 GNG7O60262 68 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA3O95167 84 aa-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms