RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560253.1

MEIS3-208, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-208ENST00000560253 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 HERVK_113P61574 105 aa9.04□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.04□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.04□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 LRP2P98164 4655 aa9.04□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.03□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 UBE2AP49459 152 aa9.03□□□□□ -0.96
MEIS3-208ENST00000560253 S100A1P23297 94 aa9.02□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 A0A0U1RRA0 63 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 DPM2O94777 84 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 IGKV2D-28P01615 120 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.01□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 VPREB1P12018 145 aa9□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 LEPROTO15243 131 aa8.99□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 IGKCP01834 107 aa8.99□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 SMIM13P0DJ93 91 aa8.99□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00310P59036 64 aa8.98□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 M0R378 163 aa8.97□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 S100A12P80511 92 aa8.97□□□□□ -0.97
MEIS3-208ENST00000560253 SCO1O75880 301 aa8.96□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.96□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 NMUP48645 174 aa8.96□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.96□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.96□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.96□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 J3QQQ9 107 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BKO60814 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BJP06899 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BOP23527 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BBP33778 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BDP58876 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BCP62807 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM126AQ9H061 195 aa8.95□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 CRYGAP11844 174 aa8.94□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.94□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.93□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM238C9JI98 176 aa8.91□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.91□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 PRLHP81277 87 aa8.9□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 PET117Q6UWS5 81 aa8.9□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.9□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.9□□□□□ -0.98
MEIS3-208ENST00000560253 E9PLD3 99 aa8.89□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 PRYO14603 147 aa8.89□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 NCR3O14931 201 aa8.88□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.88□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.88□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 Q8NDZ9 215 aa8.88□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.87□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.87□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.87□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.87□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 TNXBP22105 4242 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 C20orf202A1L168 122 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 LINC01545Q5VT33 79 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 DAND5Q8N907 189 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.85□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 AKR1D1P51857 326 aa8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
MEIS3-208ENST00000560253 A0A087X002 238 aa8.83□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 A0A0J9YXY3 114 aa8.83□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 NDUFC2O95298 119 aa8.83□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 DDTP30046 118 aa8.83□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 KRTDAPP60985 99 aa8.83□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.83□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 C3orf79P0CE67 100 aa8.82□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 TSPAN13O95857 204 aa8.81□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 TIMM17BO60830 172 aa8.8□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 SPRR1AP35321 89 aa8.8□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 PRR4Q16378 134 aa8.8□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 ZNF815PA8K554 130 aa8.79□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 NPC2P61916 151 aa8.79□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 CTAG1AP78358 180 aa8.78□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.78□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.78□□□□□ -1
MEIS3-208ENST00000560253 COPS9Q8WXC6 57 aa8.77□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 SPRR4Q96PI1 79 aa8.77□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms