RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 ERG28Q9UKR5 140 aa9.9□□□□□ -0.82
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TSPAN3-204ENST00000558394 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.87□□□□□ -0.83
TSPAN3-204ENST00000558394 CST9LQ9H4G1 147 aa9.87□□□□□ -0.83
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TSPAN3-204ENST00000558394 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.52□□□□□ -0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.51□□□□□ -0.89
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TSPAN3-204ENST00000558394 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.51□□□□□ -0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.5□□□□□ -0.89
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