RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548288.5

PFKM-211, Transcript of phosphofructokinase, muscle, humanhuman

TSL 4

Gene PFKM, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKM-211ENST00000548288 A0A087WYN8 130 aa5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 TMEM238C9JI98 176 aa5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 TIMM17BO60830 172 aa5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 Q6ZVH6 145 aa5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 SCXQ7RTU7 201 aa5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PFKM-211ENST00000548288 RYR1P21817 5038 aa5.09□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 A0A0J9YXY3 114 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 CHTF8P0CG12 524 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SMIM13P0DJ93 91 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 HIGD1BQ9P298 99 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 XGP55808 180 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 PCP2Q8IVA1 136 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.07□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 FAT1Q14517 4588 aa5.06□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 A0A0U1RRA0 63 aa5.06□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 A0A1B0GV90 55 aa5.06□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.06□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 EPM2AB3EWF7 344 aa5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 M0QXV9 152 aa5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 IFITM1P13164 125 aa5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 UBE2BP63146 152 aa5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 HSD52Q0P140 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 A0A1W2PNN7 141 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 PANO1I0J062 215 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 NDUFC2O95298 119 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 BATFQ16520 125 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 C22orf24Q9Y442 160 aa5.04□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 M0R378 163 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 TAL2Q16559 108 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 Q8N1X5 172 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 SPANXCQ9NY87 97 aa5.03□□□□□ -1.6
PFKM-211ENST00000548288 FAM168BA1KXE4 195 aa5.02□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.02□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 VPREB1P12018 145 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 HAMPP81172 84 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 DAND5Q8N907 189 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 HIST1H4GQ99525 98 aa5.01□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 HERC2O95714 4834 aa5□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 TAX1BP3O14907 124 aa5□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 Q5VSD8 79 aa5□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 LINC00167Q96N53 147 aa5□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 LITAFQ99732 161 aa5□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.99□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 A6NDN8 102 aa4.99□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 A6NJY4 79 aa4.99□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 CEND1Q8N111 149 aa4.99□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 TMEM126AQ9H061 195 aa4.99□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 A0A1B0GWB2 263 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 GAGE10A6NGK3 116 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 FXYD2P54710 66 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 NPC2P61916 151 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 C1orf137Q5JT78 98 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.98□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.97□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.97□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 PRYO14603 147 aa4.97□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 NCR3O14931 201 aa4.97□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 IGKV2D-28P01615 120 aa4.97□□□□□ -1.61
PFKM-211ENST00000548288 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms