RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 A8MTW9 85 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.05□□□□□ -2.082e-6■■■■■ 29.5
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JMJD1C-210ENST00000542921 Q8N1X5 172 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZSN1 163 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF861PO60384 105 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SPTBP11277 2137 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 USF3Q68DE3 2245 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SPTBN2O15020 2390 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 SBF1O95248 1867 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.05□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 M0QZ58 72 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPM7Q96QT4 1865 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 IGFL1Q6UW32 110 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 AKAP6Q13023 2319 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 COL4A3Q01955 1670 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ATG2BQ96BY7 2078 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.04□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 NCKAP5O14513 1909 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 MYOFQ9NZM1 2061 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 PI4KAP42356 2102 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A096LNJ9 63 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 C10orf142B7Z368 130 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 UNC13CQ8NB66 2214 aa2.03□□□□□ -2.08
JMJD1C-210ENST00000542921 Q8NA96 180 aa2.03□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 MYLKQ15746 1914 aa2.03□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PCNTO95613 3336 aa2.03□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 KMT2EQ8IZD2 1858 aa2.03□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 GPR179Q6PRD1 2367 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK11Q5JSL3 2073 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCA2Q9BZC7 2435 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 KNL1Q8NG31 2342 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 WDR81Q562E7 1941 aa2.02□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 RLFQ13129 1914 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ALPK2Q86TB3 2170 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
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JMJD1C-210ENST00000542921 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 NUP210LQ5VU65 1888 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.01□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 CACNA1EQ15878 2313 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK3Q8IZD9 2030 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK8Q8NF50 2099 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ESPL1Q14674 2120 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 APC2O95996 2303 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 Q5W150 140 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 SPRR4Q96PI1 79 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 CUL9Q8IWT3 2517 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PCNX1Q96RV3 2341 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PLXNB1O43157 2135 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 TNP1P09430 55 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ALPK3Q96L96 1907 aa2□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
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JMJD1C-210ENST00000542921 COL4A5P29400 1685 aa1.99□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 MED12Q93074 2177 aa1.99□□□□□ -2.09
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JMJD1C-210ENST00000542921 CRIP1P50238 77 aa1.99□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 GAS8-AS1O95177 125 aa1.99□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.99□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.98□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 HELZP42694 1942 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
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JMJD1C-210ENST00000542921 PRR14LQ5THK1 2151 aa1.98□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 COL4A1P02462 1669 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 EML6Q6ZMW3 1958 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCA1O95477 2261 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 COL6A5A8TX70 2615 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 Q5VV11 94 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 OBSL1O75147 1896 aa1.97□□□□□ -2.09
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM131Q92545 1883 aa1.97□□□□□ -2.09
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