RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 A0A1B0GUV1 79 aa6.96□□□□□ -1.29
TOP3A-208ENST00000542570 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
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TOP3A-208ENST00000542570 GHRHP01286 108 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZQY7 126 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 COX7BP24311 80 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.94□□□□□ -1.3
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TOP3A-208ENST00000542570 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.93□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 LINC01546A6NGU7 62 aa6.93□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 ENHOQ6UWT2 76 aa6.93□□□□□ -1.3
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TOP3A-208ENST00000542570 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.91□□□□□ -1.3
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.9□□□□□ -1.31
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TOP3A-208ENST00000542570 TRACP01848 142 aa6.9□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 TENM3Q9P273 2699 aa6.9□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 VPS13CQ709C8 3753 aa6.9□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 A0A087WYN8 130 aa6.9□□□□□ -1.31
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TOP3A-208ENST00000542570 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.88□□□□□ -1.31
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TOP3A-208ENST00000542570 LST1O00453 97 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 H3BT86 120 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 CHTF8P0CG12 524 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 C14orf177Q52M58 125 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 M0QXV9 152 aa6.86□□□□□ -1.31
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TOP3A-208ENST00000542570 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 PRLHP81277 87 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3A-208ENST00000542570 CDK2AP2O75956 126 aa6.84□□□□□ -1.31
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TOP3A-208ENST00000542570 B9D2Q9BPU9 175 aa6.83□□□□□ -1.32
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TOP3A-208ENST00000542570 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.82□□□□□ -1.32
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TOP3A-208ENST00000542570 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 TGP01266 2768 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 LITAFQ99732 161 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 TENM2Q9NT68 2774 aa6.81□□□□□ -1.32
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TOP3A-208ENST00000542570 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.8□□□□□ -1.32
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TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZRP5 223 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 FAM104AQ969W3 186 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 C22orf24Q9Y442 160 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 XGP55808 180 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 Q8N814 137 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFS5O43920 106 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 MUC7Q8TAX7 377 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-208ENST00000542570 C7orf33Q8WU49 177 aa6.78□□□□□ -1.32
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TOP3A-208ENST00000542570 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00167Q96N53 147 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 H3BNG1 76 aa6.76□□□□□ -1.33
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TOP3A-208ENST00000542570 KIAA0087Q14695 138 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 C2orf48Q96LS8 159 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 A0A1B0GX51 115 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf137Q5JT78 98 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 REG3GQ6UW15 175 aa6.73□□□□□ -1.33
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