RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R378 163 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 BAGE3Q86Y29 109 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 PRLHP81277 87 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM126AQ9H061 195 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2AP49459 152 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.84□□□□□ -1.31
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CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM223A0PJW6 202 aa6.83□□□□□ -1.32
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CLSTN3-211ENST00000541667 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.82□□□□□ -1.32
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CLSTN3-211ENST00000541667 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 TRGC2P03986 189 aa6.8□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00158P58513 81 aa6.8□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.8□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.8□□□□□ -1.32
CLSTN3-211ENST00000541667 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLSTN3-211ENST00000541667 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-211ENST00000541667 SPRR4Q96PI1 79 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-211ENST00000541667 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-211ENST00000541667 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLSTN3-211ENST00000541667 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLSTN3-211ENST00000541667 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-211ENST00000541667 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.74□□□□□ -1.33
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CLSTN3-211ENST00000541667 PRYO14603 147 aa6.73□□□□□ -1.33
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CLSTN3-211ENST00000541667 SERF1AO75920 110 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ERC2-IT1O76042 136 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00483Q53H64 154 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00587B1AMM8 73 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 LEPROTO15243 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 LEPROTL1O95214 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A6P06703 90 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLSTN3-211ENST00000541667 J3QQQ9 107 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0U1RQV1 116 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 C5orf52A6NGY3 159 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV6-57P01721 117 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-211ENST00000541667 DPM2O94777 84 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SPINK1P00995 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DDTP30046 118 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.64□□□□□ -1.35
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