RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-210ENST00000541576 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
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THBS3-210ENST00000541576 A0A087WZ39 114 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-210ENST00000541576 NUPR2A6NF83 97 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-210ENST00000541576 C5orf47Q569G3 176 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-210ENST00000541576 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-210ENST00000541576 C5orf38Q86SI9 138 aa5.87□□□□□ -1.47
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THBS3-210ENST00000541576 C6orf223Q8N319 242 aa5.76□□□□□ -1.49
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THBS3-210ENST00000541576 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.74□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 C10orf25Q5T742 122 aa5.74□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.74□□□□□ -1.49
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THBS3-210ENST00000541576 COPS9Q8WXC6 57 aa5.74□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 CASC10Q5T4H9 136 aa5.73□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 SCXQ7RTU7 201 aa5.73□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.73□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.72□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.72□□□□□ -1.49
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