RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526493.1

UBASH3B-204, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-204ENST00000526493 PSCAO43653 123 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 RNF151Q2KHN1 245 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 Q6ZR54 194 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 KMT2AQ03164 3969 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 A0A1W2PPM0 123 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 IGKV2D-28P01615 120 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 CARD19Q96LW7 228 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 LY6G6CO95867 125 aa8.49□□□□□ -1.05
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UBASH3B-204ENST00000526493 Q8NDZ9 215 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 H7C2G1 150 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 NDUFC2O95298 119 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 VAMP3Q15836 100 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 FABP2P12104 132 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 C14orf177Q52M58 125 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 Q6ZRP5 223 aa8.47□□□□□ -1.05
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UBASH3B-204ENST00000526493 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 Q1RN00 199 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 K7EP34 96 aa8.44□□□□□ -1.06
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UBASH3B-204ENST00000526493 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.44□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.44□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.44□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 GAGE10A6NGK3 116 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 TRIAP1O43715 76 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 PSMB2P49721 201 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 UBE2V1Q13404 147 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 NCR3O14931 201 aa8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 VPREB1P12018 145 aa8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.41□□□□□ -1.06
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UBASH3B-204ENST00000526493 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 A0A087WTM6 91 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 Q8N814 137 aa8.4□□□□□ -1.06
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UBASH3B-204ENST00000526493 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.39□□□□□ -1.07
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UBASH3B-204ENST00000526493 IGLV6-57P01721 117 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 COX6CP09669 75 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 TMEM126AQ9H061 195 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.36□□□□□ -1.07
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UBASH3B-204ENST00000526493 M0R378 163 aa8.36□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.36□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.36□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM168BA1KXE4 195 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 C16orf90A8MZG2 172 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 CLEC2BQ92478 149 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.34□□□□□ -1.07
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UBASH3B-204ENST00000526493 ATXN8Q156A1 80 aa8.33□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 LINC01620Q4KN68 170 aa8.33□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 PKD1P98161 4303 aa8.33□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 LST1O00453 97 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 TNP2Q05952 138 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 PRO0461Q9UI25 63 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 C7orf33Q8WU49 177 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 H0YGX0 51 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 CHTF8P0CG12 524 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 C6orf99Q4VX62 202 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 MTURNQ8N3F0 131 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 C22orf24Q9Y442 160 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 LCE6AA0A183 80 aa8.29□□□□□ -1.08
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