RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526193.5

RBBP4-217, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 4

Gene RBBP4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-217	ENST00000526193	PFN2	P35080	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	SPRR1A	P35321	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	HERV-K104	P63124	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	NDUFA6	P56556	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	PRY	O14603	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	PRLH	P81277	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193		Q8NDZ9	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	TSPAN13	O95857	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	LINC00158	P58513	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	S100A12	P80511	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-217	ENST00000526193	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	HSBP1	O75506	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	SPINK1	P00995	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	SCO1	O75880	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	NDUFC2	O95298	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	PLN	P26678	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	NMU	P48645	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	LEPROT	O15243	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	COLCA2	A8K830	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193		B5MCH6	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193		J3QQQ9	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	TRGC2	P03986	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	HERVK_113	P61574	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193		Q6ZRX8	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	DPM2	O94777	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	LINC00310	P59036	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-217	ENST00000526193	DDT	P30046	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193		A0A0U1RRA0	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	SERF1A	O75920	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193		Q8NBF4	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193		E9PLD3	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	SLC25A20	O43772	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	TIMM17B	O60830	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	IGKC	P01834	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	SPRR1B	P22528	89 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	NCR3	O14931	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193		Q8N377	158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193		Q9BRP9	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBBP4-217	ENST00000526193		A0A0J9YXY3	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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