RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518413.2

TMPRSS4-204, Transcript of transmembrane serine protease 4, human

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 700 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	BATF	Q16520	125 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q6ZRP5	223 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CFC1	P0CG37	223 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A6NDN8	102 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A0B4J2C4	111 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NDUFC2	O95298	119 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q8NDZ9	215 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413		K7ERJ3	54 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGKV2D-28	P01615	120 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C16orf90	A8MZG2	172 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	VPREB1	P12018	145 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A096LNI7	61 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TSPAN13	O95857	204 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMPRSS4-204	ENST00000518413	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NCR3	O14931	201 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	EPM2A	B3EWF7	344 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		M0R378	163 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	GHRH	P01286	108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A1W2PNN7	141 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		H3BUT2	72 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PANO1	I0J062	215 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TMEM126A	Q9H061	195 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A1B0GVY2	172 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		H7C2G1	150 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C7orf33	Q8WU49	177 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PKD1	P98161	4303 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A1W2PPM0	123 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TRIAP1	O43715	76 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A1B0GV90	55 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q1RN00	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00167	Q96N53	147 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q6ZSA8	131 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A087WYN8	130 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413		M0QXV9	152 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMPRSS4-204	ENST00000518413	KRTAP10-1	P60331	282 aa		7.25	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms