RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1B0GVG6 124 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 MT-ND4LP03901 98 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 MT-ND6P03923 174 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 G0S2P27469 103 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 SEC11AP67812 179 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 LCE3AQ5TA76 89 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2D1P51668 147 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA0087Q14695 138 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZN92 141 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 Q8N8P6 123 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 DIRC1Q969H9 104 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01549A6NIU2 74 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 IGIPA6NJ69 53 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV7-43P04211 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 RAB14P61106 215 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 C1orf137Q5JT78 98 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 AMELXQ99217 191 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 VCX2Q9H322 139 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-225ENST00000515835 LRP2P98164 4655 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 Q8IZM0 81 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 M0QXV9 152 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 CXCL5P42830 114 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 CKS1BP61024 79 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 HERVK_113P63121 156 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 HIST1H4GQ99525 98 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TIMM17AQ99595 171 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 RNF213Q63HN8 5207 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 F8VRH5 84 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 NUPR1O60356 82 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2BP63146 152 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 CLLU1Q5K131 121 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 UQCC3Q6UW78 93 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 C2orf82Q6UX34 121 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TOMM6Q96B49 74 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TNXBP22105 4242 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01546A6NGU7 62 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 COX19Q49B96 90 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM218A2RU14 115 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 SEC11CQ9BY50 192 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 C22orf24Q9Y442 160 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 S100PP25815 95 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-225ENST00000515835 BCE1O60756 84 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 COX7B2Q8TF08 81 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 ADCYAP1P18509 176 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 CTAG1AP78358 180 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 PMVKQ15126 192 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 RHEBQ15382 184 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 CST9LQ9H4G1 147 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 H3BRM9 83 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 COX17Q14061 63 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 SFTA2Q6UW10 78 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 FA2HQ7L5A8 372 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 ATP5LO75964 103 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 IGLC3P0DOY3 106 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 CRYGAP11844 174 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 HBDP02042 147 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 SPINK8P0C7L1 97 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00614P0C842 121 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 RAB5BP61020 215 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 IFITM2Q01629 132 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.48□□□□□ -1.85
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