RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 SPAG11BQ08648 103 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 C1orf137Q5JT78 98 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 NUP35Q8NFH5 326 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 C20orf78Q9BR46 151 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 OSTCQ9NRP0 149 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RNF213Q63HN8 5207 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 LRP2P98164 4655 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 HIGD1CA8MV81 97 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 F8W036 122 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 K7EN84 100 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 NUPR1O60356 82 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 PPBPP02775 128 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 IGLV7-43P04211 117 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 G0S2P27469 103 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 HBBP68871 147 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 LINC01549A6NIU2 74 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 ZNF727A8MUV8 499 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SMLR1H3BR10 107 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 K7EMI3 77 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TSPAN13O95857 204 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RAB4AP20338 218 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 UBE2BP63146 152 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SEC11AP67812 179 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.1□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PNN7 141 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RAB5AP20339 215 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 CKS2P33552 79 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 CEBPGP53567 150 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 C5orf38Q86SI9 138 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 AMN1Q8IY45 258 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.09□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 M0QXV9 152 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 Q6ZUT4 128 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 ORMDL3Q8N138 153 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 TMEM141Q96I45 108 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 NAT8Q9UHE5 227 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 V9GYV3 84 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 CRYGAP11844 174 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 CKS1BP61024 79 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 HERVK_113P63121 156 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 PEA15Q15121 130 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 AKAP14Q86UN6 197 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 Q8IZM0 81 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.07□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 D6R8Y8 96 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 F8VRH5 84 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 BCE1O60756 84 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 RPL23P62829 140 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 ADIRFQ15847 76 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 SFTA2Q6UW10 78 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 ALKAL2Q6UX46 152 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 TIMM17AQ99595 171 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 A0A1B0GXF2 115 aa2.05□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 SMKR1H3BMG3 65 aa2.05□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 NPYP01303 97 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms