RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 SPAG11BQ08648 103 aa2.12□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 NUP35Q8NFH5 326 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 C20orf78Q9BR46 151 aa2.12□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 RNF213Q63HN8 5207 aa2.12□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.11□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 HIGD1CA8MV81 97 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 F8W036 122 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 K7EN84 100 aa2.11□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 IGLV7-43P04211 117 aa2.11□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 HBBP68871 147 aa2.11□□□□□ -2.07
RBM39-241ENST00000496183 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.11□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.11□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.1□□□□□ -2.07
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RBM39-241ENST00000496183 ORMDL3Q8N138 153 aa2.08□□□□□ -2.08
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RBM39-241ENST00000496183 NAT8Q9UHE5 227 aa2.08□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 V9GYV3 84 aa2.08□□□□□ -2.08
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RBM39-241ENST00000496183 PEA15Q15121 130 aa2.07□□□□□ -2.08
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RBM39-241ENST00000496183 ALKAL2Q6UX46 152 aa2.06□□□□□ -2.08
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RBM39-241ENST00000496183 TIMM17AQ99595 171 aa2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 A0A1B0GXF2 115 aa2.05□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 SMKR1H3BMG3 65 aa2.05□□□□□ -2.08
RBM39-241ENST00000496183 NPYP01303 97 aa2.05□□□□□ -2.08
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