RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 ERG28Q9UKR5 140 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 LRP2P98164 4655 aa6.31□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.31□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 VPREB1P12018 145 aa6.31□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.31□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 A0A087X002 238 aa6.3□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 TMEM223A0PJW6 202 aa6.3□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 TRGC2P03986 189 aa6.3□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 TMEM238C9JI98 176 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 H0Y8G0 127 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 LINC00310P59036 64 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.28□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 PRLHP81277 87 aa6.28□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.28□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 HSBP1O75506 76 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 SERF1AO75920 110 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 TSPAN13O95857 204 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 UBE2AP49459 152 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 LINC00158P58513 81 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 SMIM13P0DJ93 91 aa6.26□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 COX17Q14061 63 aa6.26□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 TMEM126AQ9H061 195 aa6.26□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 M0R378 163 aa6.25□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.25□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.25□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.24□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 PRR4Q16378 134 aa6.24□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.24□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 COLCA2A8K830 154 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 NCR3O14931 201 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 CRYGAP11844 174 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 FABP4P15090 132 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 LPAP08519 4548 aa6.22□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 LEPROTL1O95214 131 aa6.22□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.22□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.22□□□□□ -1.41
NELFE-213ENST00000494956 SFTA2Q6UW10 78 aa6.21□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.21□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 DAND5Q8N907 189 aa6.21□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 ATP6V1G1O75348 118 aa6.2□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.2□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 LEPROTO15243 131 aa6.19□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.19□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.19□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.19□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.18□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 HERV-K104P63124 156 aa6.18□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 RNF213Q63HN8 5207 aa6.17□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.17□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 DPM2O94777 84 aa6.17□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.17□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 J3QQQ9 107 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 IGKCP01834 107 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 PLNP26678 52 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 PRYO14603 147 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 NPC2P61916 151 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 SPRR4Q96PI1 79 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BKO60814 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BJP06899 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BOP23527 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BBP33778 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 SPRR1AP35321 89 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BDP58876 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BCP62807 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 HERVK_113P61574 105 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 LINC00587B1AMM8 73 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 ERC2-IT1O76042 136 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 A0A0J9YXY3 114 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 DDTP30046 118 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 B5MCH6 92 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 E9PLD3 99 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 NMUP48645 174 aa6.1□□□□□ -1.43
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