RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-215ENST00000494945 RAB37Q96AX2 223 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 K7ERJ3 54 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 GAGE2EQ4V326 116 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 TAX1BP3O14907 124 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 TNP2Q05952 138 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.09□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 C16orf90A8MZG2 172 aa7.09□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 IGKV2D-28P01615 120 aa7.09□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 GAGE2BQ13066 116 aa7.09□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 C9orf118A6NHY6 69 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 VPREB1P12018 145 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 Q8NDZ9 215 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 A0A096LNI7 61 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 NCR3O14931 201 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 TSPAN13O95857 204 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.06□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 H3BUT2 72 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 H7C2G1 150 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 M0R378 163 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 Q1RN00 199 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 TMEM126AQ9H061 195 aa7.05□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 LINC01620Q4KN68 170 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.04□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 IGLV6-57P01721 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.03□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 PKD1P98161 4303 aa7.03□□□□□ -1.28
PKP4-215ENST00000494945 A0A1W2PPM0 123 aa7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 FAM168BA1KXE4 195 aa7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 PSMB2P49721 201 aa7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.02□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 COX6CP09669 75 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 CHTF8P0CG12 524 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 FABP2P12104 132 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 KRTAP10-2P60368 255 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 DNAH11Q96DT5 4516 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 A0A1B0GV90 55 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 TRIAP1O43715 76 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 C7orf33Q8WU49 177 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 C22orf24Q9Y442 160 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 A0A1W2PNN7 141 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 PANO1I0J062 215 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 M0QXV9 152 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 VAMP3Q15836 100 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 LINC00167Q96N53 147 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 GAGE10A6NGK3 116 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 EPM2AB3EWF7 344 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 DPH3Q96FX2 82 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-215ENST00000494945 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 H0YGX0 51 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 PRYO14603 147 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 RYR2Q92736 4967 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 A0A087WYN8 130 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 A0A1B0GVY2 172 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 K7EP34 96 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 C6orf99Q4VX62 202 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 DIRC1Q969H9 104 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-215ENST00000494945 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.95□□□□□ -1.3
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