RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LINC00846Q9NV44 126 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 COL6A5A8TX70 2615 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 LECT2O14960 151 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 WIPF1O43516 503 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 IMUPQ9GZP8 106 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 OXTP01178 125 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 KLK12Q9UKR0 248 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 C6orf223Q8N319 242 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 H0YGX0 51 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 LELP1Q5T871 98 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 C10orf25Q5T742 122 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 J3KT08 172 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 Q8NDZ9 215 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 C4orf26Q17RF5 130 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 ENHOQ6UWT2 76 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 CXCL5P42830 114 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZTC4 211 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 ATOX1O00244 68 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 CRYGAP11844 174 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 SPAG11BQ08648 103 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 PRR34Q9NV39 138 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 USP17L23D6RBM5 183 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 C5orf47Q569G3 176 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 DPH3Q96FX2 82 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-213ENST00000492657 COX17Q14061 63 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 UPK3BQ9BT76 320 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YWU9 116 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 SERP2Q8N6R1 65 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 ESRGQ1W209 222 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 NDUFC2O95298 119 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 Q8N814 137 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 GHRHP01286 108 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 C6orf99Q4VX62 202 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 C20orf197Q8N268 126 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 Q6JHZ5 121 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 M0R2N4 97 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 H3BNG1 76 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 CCKP06307 115 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 Q5XG85 94 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 F8WDY8 70 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 TMEM258P61165 79 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 LINC00167Q96N53 147 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 SNURFQ9Y675 71 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 C15orf56Q8N910 161 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZRU5 148 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 IGLV6-57P01721 117 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 LINC00575Q6W349 94 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 MRAPQ8TCY5 172 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 SCXQ7RTU7 201 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 HAMPP81172 84 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 MUC7Q8TAX7 377 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 COL7A1Q02388 2944 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 RMI2Q96E14 147 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 VPREB1P12018 145 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZQY7 126 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 UBL5Q9BZL1 73 aa8.47□□□□□ -1.05
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