RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 PET117Q6UWS5 81 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 C3orf79P0CE67 100 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 UBE2BP63146 152 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 LINC01545Q5VT33 79 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 HERVK_113P61574 105 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 ERG28Q9UKR5 140 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-212ENST00000492539 LEPROTO15243 131 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 KRTDAPP60985 99 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 COX17Q14061 63 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 S100A6P06703 90 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 PFN2P35080 140 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 S100A2P29034 98 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 HERV-K104P63124 156 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 PRR4Q16378 134 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.84□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 C20orf202A1L168 122 aa11.84□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 J3QQQ9 107 aa11.84□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 ZNF861PO60384 105 aa11.84□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.84□□□□□ -0.51
NELFE-212ENST00000492539 E9PLD3 99 aa11.83□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 NMUP48645 174 aa11.82□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.81□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 LINC00587B1AMM8 73 aa11.8□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 AKR1D1P51857 326 aa11.8□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 LINC00158P58513 81 aa11.8□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.8□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 C22orf24Q9Y442 160 aa11.8□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 SMIM13P0DJ93 91 aa11.79□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.79□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.78□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 C5orf52A6NGY3 159 aa11.78□□□□□ -0.52
NELFE-212ENST00000492539 A0A0U1RRA0 63 aa11.77□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 A0A087X002 238 aa11.74□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.74□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 FAT4Q6V0I7 4981 aa11.74□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.73□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 VPREB1P12018 145 aa11.73□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 ATOH7Q8N100 152 aa11.73□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.73□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 A0A0U1RQV1 116 aa11.72□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 TSPAN13O95857 204 aa11.72□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 A0A0J9YXY3 114 aa11.71□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 BCE1O60756 84 aa11.71□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 LINC00167Q96N53 147 aa11.71□□□□□ -0.53
NELFE-212ENST00000492539 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 Q8NDZ9 215 aa11.7□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 ZNF815PA8K554 130 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 CRYGAP11844 174 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 DAND5Q8N907 189 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 MUC17Q685J3 4493 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 GAGE10A6NGK3 116 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 TIMM17BO60830 172 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-212ENST00000492539 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 LITAFQ99732 161 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.63□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.63□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.62□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 M0R378 163 aa11.62□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 SCGB1D1O95968 90 aa11.62□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.62□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.62□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.61□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 IGKV2D-28P01615 120 aa11.61□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 PCP2Q8IVA1 136 aa11.6□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 NCR3O14931 201 aa11.59□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.59□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.59□□□□□ -0.55
NELFE-212ENST00000492539 NDUFC2O95298 119 aa11.58□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.58□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.57□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 NPC2P61916 151 aa11.57□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.57□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 TMEM238C9JI98 176 aa11.56□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 UBE2AP49459 152 aa11.56□□□□□ -0.56
NELFE-212ENST00000492539 TMEM126AQ9H061 195 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms