RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 FABP5P3A8MUU1 101 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 F8W036 122 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GNRH2O43555 120 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PPBPP02775 128 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 MT-ND4LP03901 98 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TYMSP04818 313 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SRP19P09132 144 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 EVI2AP22794 236 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 AKR1C3P42330 323 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL35P42766 123 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GNG4P50150 75 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 AKR1D1P51857 326 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2G1P62253 170 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10J3Q5JRS4 329 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 EBLN2Q6P2I7 272 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 MIR17HGQ75NE6 70 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 Q86TA4 180 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 COMMD7Q86VX2 200 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8TAT8 98 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TSKUQ8WUA8 353 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 MRAP2Q96G30 205 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SFRP2Q96HF1 295 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM7Q9BQ49 75 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 IL36BQ9NZH7 164 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 HHLA3Q9XRX5 114 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TRGV2A0A075B6R0 118 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A096LNI7 61 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF727A8MUV8 499 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 K7EP13 123 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PYYP10082 97 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 ADCYAP1P18509 176 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 S100PP25815 95 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 G0S2P27469 103 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SRIP30626 198 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 RANP62826 216 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 BAGE2Q86Y30 109 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 RETNLBQ9BQ08 111 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GNB1LQ9BYB4 327 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM191AQ9H0A3 160 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SMCO4Q9NRQ5 59 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GNG13Q9P2W3 67 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 NAT8BQ9UHF3 227 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV4A0A0B4J268 109 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GUT8 65 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01546A6NGU7 62 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 HIGD1CA8MV81 97 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 A8MWV9 139 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R2P5 195 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R381 172 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 APOC3P02656 99 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GPX1P07203 203 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TRGC1P0CF51 173 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLC6P0CF74 106 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PKIAP61925 76 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 HBBP68871 147 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SMAGPQ0VAQ4 97 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 ELOBQ15370 118 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM97Q5BJF2 176 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPWQ5EE01 88 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP126Q5VTH2 177 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM15Q7Z3B0 74 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 C10orf126Q8N4M7 172 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 BORCS7Q96B45 105 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf78Q9BR46 151 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TREM1Q9NP99 234 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 V9GYV3 84 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R036 132 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CCL25O15444 150 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 NCR2O95944 276 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ORM1P02763 201 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MGST1P10620 155 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ESDP10768 282 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CRIP1P50238 77 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2G2P60604 165 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB5BP61020 215 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CNBPP62633 177 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 COX6A2Q02221 97 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 Q0VG73 95 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM229BQ4G0N7 80 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PCOTHQ58A44 107 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CLPSL2Q6UWE3 100 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms