RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.42□□□□□ -1.22
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C9orf3-220ENST00000489318 Q8NDZ9 215 aa7.41□□□□□ -1.22
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C9orf3-220ENST00000489318 PKD1P98161 4303 aa7.27□□□□□ -1.25
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C9orf3-220ENST00000489318 VAMP3Q15836 100 aa7.26□□□□□ -1.25
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C9orf3-220ENST00000489318 PRYO14603 147 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 TCL1BO95988 128 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 SPRR1AP35321 89 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZSA8 131 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 GAGE10A6NGK3 116 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 H0YGX0 51 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 LST1O00453 97 aa7.23□□□□□ -1.25
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