RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 LELP1Q5T871 98 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFA1O15239 70 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 TIMM17BO60830 172 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 AMELXQ99217 191 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFS5O43920 106 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 CXCL5P42830 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 RMI2Q96E14 147 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 SPANXCQ9NY87 97 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 KRTAP10-11P60412 298 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6Q795 121 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 C6orf99Q4VX62 202 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK2AP2O75956 126 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 UBE2BP63146 152 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf195Q5TG92 126 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 C3orf84H3BNL1 204 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.335e-6■□□□□ 10.3
PTPRVP-201ENST00000482597 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 C6orf223Q8N319 242 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 Q8NAQ8 132 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A096LNI7 61 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 A8MTW9 85 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 IMUPQ9GZP8 106 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 C4orf26Q17RF5 130 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRVP-201ENST00000482597 IGKV2D-28P01615 120 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRVP-201ENST00000482597 CCKP06307 115 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRVP-201ENST00000482597 PSPHP1O15172 72 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 K7EIL1 84 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 LY6G6CO95867 125 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 Q8IZM0 81 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRVP-201ENST00000482597 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRVP-201ENST00000482597 PDZD2O15018 2839 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 COX7BP24311 80 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 H0Y9J4 135 aa6.61□□□□□ -1.35
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PTPRVP-201ENST00000482597 PMAIP1Q13794 54 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 A6NED7 52 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 C10orf25Q5T742 122 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 IL17DQ8TAD2 202 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6JHZ5 121 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 Q8N9L7 120 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZRU5 148 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 IGKV4-1P06312 121 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.56□□□□□ -1.36
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