RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	RAB5B	P61020	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	SCO1	O75880	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	PRLH	P81277	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	VPREB1	P12018	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096		M0R378	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	ATP5L	O75964	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096		H3BRM9	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	PFN2	P35080	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	PMVK	Q15126	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A1B0GVG6	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	COX17	Q14061	63 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8NDZ9	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	RAB14	P61106	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE2F-222	ENST00000482096	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	SPINK1	P00995	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	DAND5	Q8N907	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8NBF4	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A096LNJ9	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	NDUFA6	P56556	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	SPRR1A	P35321	89 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00158	P58513	81 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	COX19	Q49B96	90 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	S100P	P25815	95 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A0U1RRA0	63 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8N377	158 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBE2F-222	ENST00000482096	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	HBD	P02042	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00614	P0C842	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	NCR3	O14931	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC25A20	O43772	301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	MOBP	Q13875	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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