RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475848.2

CACNB4-208, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

Gene CACNB4, Length 1,174 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-208	ENST00000475848	ATP5L	O75964	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	PMVK	Q15126	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848		Q8IZM0	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	BCE1	O60756	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	HSBP1	O75506	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	S100A1	P23297	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848		A0A096LNJ9	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848		F8VRH5	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	TSPAN13	O95857	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	CXCL5	P42830	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	NDUFA6	P56556	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848		H3BRM9	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	SCO1	O75880	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848		A0A087X002	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	SERF1A	O75920	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-208	ENST00000475848	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	UBE2A	P49459	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	FABP4	P15090	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	PLN	P26678	52 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	COX17	Q14061	63 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848		H0Y8G0	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-208	ENST00000475848	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	DPM2	O94777	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	IGKC	P01834	107 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	HERVK_113	P61574	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	HERV-K104	P63124	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-208	ENST00000475848	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms