RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.12□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 GAGE2BQ13066 116 aa9.11□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 Q8NDZ9 215 aa9.11□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 A0A1B0GVY2 172 aa9.1□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 A4D1N5 150 aa9.1□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 C16orf90A8MZG2 172 aa9.1□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 M0R143 59 aa9.1□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 COPS9Q8WXC6 57 aa9.1□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.09□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.09□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 CHTF8P0CG12 524 aa9.08□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.08□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.08□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.07□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 PANO1I0J062 215 aa9.06□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 NDUFC2O95298 119 aa9.06□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 VPREB1P12018 145 aa9.06□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.06□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 A0A1B0GWB2 263 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 FAM168BA1KXE4 195 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 A6NJY4 79 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 IGKV2D-28P01615 120 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 CFC1BP0CG36 223 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 CFC1P0CG37 223 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 BATFQ16520 125 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.04□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 A0A0B4J2C4 111 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 K7ERJ3 54 aa9.03□□□□□ -0.96
HPS1-209ENST00000470095 A0A1W2PNN7 141 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 NCR3O14931 201 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP10-1P60331 282 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.02□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 A6NDN8 102 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 EPM2AB3EWF7 344 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 Q6ZSA8 131 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 M0R378 163 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 RAB37Q96AX2 223 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 PKD1P98161 4303 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 A0A087WYN8 130 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 C7orf33Q8WU49 177 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 C22orf24Q9Y442 160 aa8.97□□□□□ -0.97
HPS1-209ENST00000470095 M0QXV9 152 aa8.96□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 IGLV6-57P01721 117 aa8.96□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.96□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 GAGE10A6NGK3 116 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 TAX1BP3O14907 124 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 TSPAN13O95857 204 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 LINC00167Q96N53 147 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 H7C2G1 150 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 DPH3Q96FX2 82 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 TMEM126AQ9H061 195 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 SCXQ7RTU7 201 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HPS1-209ENST00000470095 HAMPP81172 84 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 Q1RN00 199 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 C9orf118A6NHY6 69 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.88□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 PRYO14603 147 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 TRIAP1O43715 76 aa8.87□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 H3BUT2 72 aa8.86□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HPS1-209ENST00000470095 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
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