RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		6.39	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM236C	P0DP71	79 aa		6.39	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COX7B2	Q8TF08	81 aa		6.39	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		6.39	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		6.38	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEFB1	P60022	68 aa		6.38	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		6.38	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM104A	Q969W3	186 aa		6.38	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.38	□□□□□ -1.39
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RUNDC3B-204	ENST00000466676		K7EQD1	137 aa		6.37	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGKV3-20	P01619	116 aa		6.37	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		6.37	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.37	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		6.37	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UPK3B	Q9BT76	320 aa		6.37	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		6.36	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676		F5H768	121 aa		6.36	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		6.36	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00158	P58513	81 aa		6.36	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
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RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RETN	Q9HD89	108 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00167	Q96N53	147 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q9HAA7	133 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00846	Q9NV44	126 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LECT2	O14960	151 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEFB131A	P59861	70 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC4	Q99102	2169 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0U1RRA0	63 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HTN1	P15515	57 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COX6A2	Q02221	97 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0J9YWU9	116 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COX17	Q14061	63 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C22orf24	Q9Y442	160 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A087WYN8	130 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CXCL6	P80162	114 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KLKP1	Q107X0	134 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DSCR8	Q96T75	97 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A087WZ39	114 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PFN2	P35080	140 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	XCL1	P47992	114 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCL18	P55774	89 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SS18	Q15532	418 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STH	Q8IWL8	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	XCL2	Q9UBD3	114 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EPM2A	B3EWF7	344 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERC2-IT1	O76042	136 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGKV2D-28	P01615	120 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEFB135	Q30KP9	77 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q8IZM0	81 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C16orf74	Q96GX8	76 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCR3	O14931	201 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q5XG85	94 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q6ZSN1	163 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C20orf197	Q8N268	126 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q8N814	137 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KMT2A	Q03164	3969 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A087WVE0	104 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FHL2	Q14192	279 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ENHO	Q6UWT2	76 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HERC2	O95714	4834 aa		6.23	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms