RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 VAMP3Q15836 100 aa6.26□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.26□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.25□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.25□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV2D-28P01615 120 aa6.25□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 FABP2P12104 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 SYCNQ0VAF6 134 aa6.25□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 K7EP34 96 aa6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 SLPIP03973 132 aa6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 WFDC2Q14508 124 aa6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 RNF151Q2KHN1 245 aa6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.24□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 H7C2G1 150 aa6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 LECT2O14960 151 aa6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFC2O95298 119 aa6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2V1Q13404 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 CARD19Q96LW7 228 aa6.23□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.22□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 Q8NDZ9 215 aa6.22□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.21□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE10A6NGK3 116 aa6.21□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.21□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 PSCAO43653 123 aa6.21□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 Q1RN00 199 aa6.21□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZR54 194 aa6.21□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 M0R2N4 97 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 TRIAP1O43715 76 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 PSMB2P49721 201 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.2□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 C3orf84H3BNL1 204 aa6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZRP5 223 aa6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.19□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.18□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 C14orf177Q52M58 125 aa6.18□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 NCR3O14931 201 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 LY6G6CO95867 125 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 TCL1BO95988 128 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 VPREB1P12018 145 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE2EQ4V326 116 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 LCE1DQ5T752 114 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.17□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.16□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.16□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.16□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.15□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 H3BMG7 143 aa6.15□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 COX6CP09669 75 aa6.15□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM126AQ9H061 195 aa6.15□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 PRO0461Q9UI25 63 aa6.15□□□□□ -1.42
SRPRB-202ENST00000466636 A0A087WTM6 91 aa6.14□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV6-57P01721 117 aa6.14□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 M0R378 163 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 LST1O00453 97 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE2BQ13066 116 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 ATXN8Q156A1 80 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 Q8N814 137 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 CLEC2BQ92478 149 aa6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.12□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.12□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.12□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.12□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 A0A096LNI7 61 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01620Q4KN68 170 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 MTURNQ8N3F0 131 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 LYSTQ99698 3801 aa6.11□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 FAM168BA1KXE4 195 aa6.1□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 C16orf90A8MZG2 172 aa6.1□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 F8W1H4 67 aa6.1□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 H0YGX0 51 aa6.1□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 C7orf33Q8WU49 177 aa6.1□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.09□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 C9JAW5 83 aa6.09□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 C6orf99Q4VX62 202 aa6.09□□□□□ -1.43
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01600Q96MT4 127 aa6.09□□□□□ -1.43
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