RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 MT1HL1P0DM35 61 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2D1P51668 147 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 HERVK_113P63121 156 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE2BQ13066 116 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WZ39 114 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PNN7 141 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 J3QQQ9 107 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GV90 55 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA0087Q14695 138 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-210ENST00000462125 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFA1O15239 70 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 C10orf25Q5T742 122 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZRP5 223 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 A6NJY4 79 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 CEND1Q8N111 149 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H4GQ99525 98 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01600Q96MT4 127 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM238C9JI98 176 aa8.17□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM13P0DJ93 91 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZVH6 145 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 TAX1BP3O14907 124 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 TIMM17BO60830 172 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 SFTA2Q6UW10 78 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf82Q6UX34 121 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 RNF213Q63HN8 5207 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 TNXBP22105 4242 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 SPINK8P0C7L1 97 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 FXYD2P54710 66 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 HERV-K104P63124 156 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 FAM168BA1KXE4 195 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf118A6NHY6 69 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-8P60410 259 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 REG3GQ6UW15 175 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 Q8IZM0 81 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 COPS9Q8WXC6 57 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0J9YXY3 114 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GWB2 263 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE2EQ4V326 116 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS2P07478 247 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 VAMP3Q15836 100 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXCQ9NY87 97 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 IFITM1P13164 125 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 CKS1BP61024 79 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf137Q5JT78 98 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf3-210ENST00000462125 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV7-43P04211 117 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2V1Q13404 147 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 COX7B2Q8TF08 81 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 FABP2P12104 132 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0B4J2C4 111 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 H3BUT2 72 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 CXCL5P42830 114 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 RAB37Q96AX2 223 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PPM0 123 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 M0QXV9 152 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 LITAFQ99732 161 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 DIRC1Q969H9 104 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE10A6NGK3 116 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf3-210ENST00000462125 K7ERJ3 54 aa8.02□□□□□ -1.13
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