RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM238C9JI98 176 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 VPREB1P12018 145 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00304Q8N9R0 145 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM126AQ9H061 195 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 ERG28Q9UKR5 140 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.99□□□□□ -1.45
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SH3BP4-206ENST00000446904 Q8NDZ9 215 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0U1RQV1 116 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf86A6NJI1 115 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R378 163 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 HBDP02042 147 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.98□□□□□ -1.45
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SH3BP4-206ENST00000446904 COX17Q14061 63 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.97□□□□□ -1.45
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SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.95□□□□□ -1.46
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SH3BP4-206ENST00000446904 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 YPEL4Q96NS1 127 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0U1RRA0 63 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 SFTA2Q6UW10 78 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 CDIP1Q9H305 208 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 TPRXLQ17RH7 258 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRR4Q96PI1 79 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM223A0PJW6 202 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM13P0DJ93 91 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 SVIPQ8NHG7 77 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V1G1O75348 118 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 NCR3O14931 201 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 CTAG1AP78358 180 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 PRYO14603 147 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 DAND5Q8N907 189 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8NBF4 154 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
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SH3BP4-206ENST00000446904 XP32Q5T750 250 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRR1AP35321 89 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.86□□□□□ -1.47
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SH3BP4-206ENST00000446904 HERV-K104P63124 156 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 COLCA2A8K830 154 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 H0Y8G0 127 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.83□□□□□ -1.48
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SH3BP4-206ENST00000446904 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.83□□□□□ -1.48
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SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.83□□□□□ -1.48
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SH3BP4-206ENST00000446904 ERC2-IT1O76042 136 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 S100A12P80511 92 aa5.82□□□□□ -1.48
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SH3BP4-206ENST00000446904 SPINK1P00995 79 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 DDTP30046 118 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 MOBPQ13875 183 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 LEPROTO15243 131 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00310P59036 64 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 Q9BRP9 147 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 J3QQQ9 107 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.79□□□□□ -1.48
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