RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445077.1

RBMS3-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RBMS3, Length 448 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS3-208	ENST00000445077	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	COL6A3	P12111	3177 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		Q8NBF4	154 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	ZNF292	O60281	2723 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		Q8NAQ8	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	HCG22	E2RYF7	251 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		M0R2N4	97 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		Q8NDZ9	215 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	HTN3	P15516	51 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		Q6ZRU5	148 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		Q6ZRX8	168 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077		Q8N377	158 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
RBMS3-208	ENST00000445077	SORL1	Q92673	2214 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	KALRN	O60229	2985 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	SPRR1A	P35321	89 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	UBE2B	P63146	152 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP10-9	P60411	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077		Q6ZRP5	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	AKAP6	Q13023	2319 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	AKAP13	Q12802	2813 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	UBE2A	P49459	152 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	SEC61G	P60059	68 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	TTC28	Q96AY4	2481 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		5.71	□□□□□ -1.49
RBMS3-208	ENST00000445077	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		A0A1W2PNM2	257 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		Q9BRP9	147 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	DEFB4A	O15263	64 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		Q8N9L7	120 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	TACC2	O95359	2948 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	DSCR10	P59022	87 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	CR1	P17927	2039 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		H0Y9J4	135 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	PSCA	O43653	123 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	NDUFS5	O43920	106 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	LRBA	P50851	2863 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC00208	Q96KT6	92 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		H3BS24	57 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	CASC2	Q6XLA1	102 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		K7EQZ3	153 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	CD164	Q04900	197 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS3-208	ENST00000445077		A8MWP4	228 aa		5.64	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms