RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 HERV-K104P63124 156 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BKO60814 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 DPM2O94777 84 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV2D-28P01615 120 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BJP06899 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BOP23527 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BBP33778 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BDP58876 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BCP62807 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 Q8NDZ9 215 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0U1RRA0 63 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM13P0DJ93 91 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00587B1AMM8 73 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 LEPROTO15243 131 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP6V1G1O75348 118 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKCP01834 107 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.47□□□□□ -1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2AP49459 152 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 HERVK_113P61574 105 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.46□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 J3QQQ9 107 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM126AQ9H061 195 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM238C9JI98 176 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 M0R378 163 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 LPAP08519 4548 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 NMUP48645 174 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 PRLHP81277 87 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 E9PLD3 99 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 NCR3O14931 201 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC01545Q5VT33 79 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 DAND5Q8N907 189 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A087X002 238 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CRYGAP11844 174 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PET117Q6UWS5 81 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PRYO14603 147 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 C3orf79P0CE67 100 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0J9YXY3 114 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 SPRR1AP35321 89 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTDAPP60985 99 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 MUC2Q02817 5179 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 NDUFC2O95298 119 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 S100A12P80511 92 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 S100A1P23297 94 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 C20orf202A1L168 122 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 DDTP30046 118 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF815PA8K554 130 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 TIMM17BO60830 172 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 NPC2P61916 151 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 LITAFQ99732 161 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV6-57P01721 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SPRR4Q96PI1 79 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPAN13O95857 204 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 B5MCH6 92 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154 ms