RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 NREPQ16612 68 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf223Q8N319 242 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 ESRGQ1W209 222 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf99Q4VX62 202 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS13CQ709C8 3753 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL6P80162 114 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFS5O43920 106 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MUN3 132 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 BPY2O14599 106 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 SMR3AQ99954 134 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 DAD1P61803 113 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N9L7 120 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 INSP01308 110 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00575Q6W349 94 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF702PQ9H963 129 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R378 163 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZTC4 211 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZQY7 126 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC7Q8TAX7 377 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 SPG11Q96JI7 2443 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB136Q30KP8 78 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8NDZ9 215 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 PSPHP1O15172 72 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00313P59037 77 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-203ENST00000439720 ERC2-IT1O76042 136 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 SLURP1P55000 103 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.71□□□□□ -1.5
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZRP5 223 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01006Q8NI28 216 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 OCR1Q9BZK8 76 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPR3Q14573 2671 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 hDV103S1A0JD37 113 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGEF1-203ENST00000439720 PDE6GP18545 87 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8IZM0 81 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-59P01825 116 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV4-1P06312 121 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGEF1-203ENST00000439720 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 MP68P56378 58 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 CELA1Q9UNI1 258 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 Q1T7F1 81 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 JMJD1CQ15652 2540 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MU10 97 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 HIVEP1P15822 2718 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-203ENST00000439720 ANK2Q01484 3957 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR4Q16378 134 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf25Q5T742 122 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 FBN3Q75N90 2809 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 COX17Q14061 63 aa5.63□□□□□ -1.51
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