RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A0U1RRA0 63 aa11.98□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11.97□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.97□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 ZNF815PA8K554 130 aa11.96□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 LINC00158P58513 81 aa11.96□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 COX17Q14061 63 aa11.96□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.96□□□□□ -0.49
CXorf40A-208ENST00000434353 SMIM13P0DJ93 91 aa11.96□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 TAL2Q16559 108 aa11.95□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A0J9YXY3 114 aa11.93□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A1W2PNN7 141 aa11.93□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 FAM168BA1KXE4 195 aa11.93□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.93□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.93□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.91□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.91□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.91□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 DAND5Q8N907 189 aa11.9□□□□□ -0.5
CXorf40A-208ENST00000434353 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.89□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 A6NDN8 102 aa11.88□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.88□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.87□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 HIST1H4GQ99525 98 aa11.87□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 CEND1Q8N111 149 aa11.86□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 RYR1P21817 5038 aa11.86□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A1B0GV90 55 aa11.85□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 EPM2AB3EWF7 344 aa11.85□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 M0QXV9 152 aa11.85□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.85□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.84□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 LITAFQ99732 161 aa11.84□□□□□ -0.51
CXorf40A-208ENST00000434353 TIMM17BO60830 172 aa11.83□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 NPC2P61916 151 aa11.82□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.82□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 TMEM238C9JI98 176 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 C7orf33Q8WU49 177 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 C22orf24Q9Y442 160 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 FXYD2P54710 66 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 Q8NDZ9 215 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.81□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.8□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 A6NJY4 79 aa11.8□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 VPREB1P12018 145 aa11.8□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 Q8N1X5 172 aa11.8□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 TAX1BP3O14907 124 aa11.79□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 FAM229AH3BQW9 127 aa11.78□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.78□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.77□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 Q5VSD8 79 aa11.77□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 Q6ZVH6 145 aa11.77□□□□□ -0.52
CXorf40A-208ENST00000434353 HSPG2P98160 4391 aa11.77□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 GAGE10A6NGK3 116 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 UBE2BP63146 152 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 SPANXCQ9NY87 97 aa11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A1B0GWB2 263 aa11.75□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 NCR3O14931 201 aa11.75□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.74□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 LINC00167Q96N53 147 aa11.74□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.73□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 C9orf118A6NHY6 69 aa11.71□□□□□ -0.53
CXorf40A-208ENST00000434353 IFITM1P13164 125 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 M0R378 163 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 NDUFC2O95298 119 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 IGKV2D-28P01615 120 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 COPS9Q8WXC6 57 aa11.7□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 HERC2O95714 4834 aa11.69□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 K7ERJ3 54 aa11.68□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 RAB37Q96AX2 223 aa11.68□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.67□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.67□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.66□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 C1orf137Q5JT78 98 aa11.66□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.65□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 A4D1N5 150 aa11.65□□□□□ -0.54
CXorf40A-208ENST00000434353 H3BUT2 72 aa11.65□□□□□ -0.55
CXorf40A-208ENST00000434353 VAMP3Q15836 100 aa11.65□□□□□ -0.55
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A0B4J2C4 111 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms