RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.22□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 BAGE3Q86Y29 109 aa12.22□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.22□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM238C9JI98 176 aa12.21□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.2□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 Q8NDZ9 215 aa12.2□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0U1RQV1 116 aa12.19□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.17□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 YPEL4Q96NS1 127 aa12.17□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM223A0PJW6 202 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMS1-208ENST00000428064 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00158P58513 81 aa12.13□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TPRXLQ17RH7 258 aa12.13□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RETNLBQ9BQ08 111 aa12.13□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.1□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MUC17Q685J3 4493 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SPRR4Q96PI1 79 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PRYO14603 147 aa12.08□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.08□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HERV-K104P63124 156 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG11AQ6PDA7 123 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0U1RRA0 63 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HSBP1O75506 76 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM13P0DJ93 91 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SPRR1AP35321 89 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00587B1AMM8 73 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1G1O75348 118 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TRGC2P03986 189 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 BOD1L2Q8IYS8 172 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CDIP1Q9H305 208 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 H0Y8G0 127 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 FAT4Q6V0I7 4981 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 NCR3O14931 201 aa12□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.99□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.99□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SERF1AO75920 110 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.96□□□□□ -0.49
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LIMS1-208ENST00000428064 LINC00483Q53H64 154 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMS1-208ENST00000428064 S100A12P80511 92 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 Q8NBF4 154 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 LEPROTO15243 131 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 PLNP26678 52 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK1P00995 79 aa11.92□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 B5MCH6 92 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 FABP4P15090 132 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 COLCA2A8K830 154 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 DAND5Q8N907 189 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMS1-208ENST00000428064 DDTP30046 118 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NMUP48645 174 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 J3QQQ9 107 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 HERVK_113P61574 105 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 DPM2O94777 84 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFC2O95298 119 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZRX8 168 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.85□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 Q9BRP9 147 aa11.85□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.85□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.85□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ERC2-IT1O76042 136 aa11.84□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.84□□□□□ -0.51
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV6-57P01721 117 aa11.83□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 IGKCP01834 107 aa11.82□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 MOBPQ13875 183 aa11.82□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.8□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.8□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.79□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N377 158 aa11.79□□□□□ -0.52
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