RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 SYCNQ0VAF6 134 aa6.75□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.75□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.74□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 C11orf86A6NJI1 115 aa6.74□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.74□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.74□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 C5orf38Q86SI9 138 aa6.74□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.74□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 RNF213Q63HN8 5207 aa6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 C9orf118A6NHY6 69 aa6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 PTTG1IPP53801 180 aa6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 VAMP3Q15836 100 aa6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.73□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.72□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 CEND1Q8N111 149 aa6.72□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 PRSS2P07478 247 aa6.71□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SMIM13P0DJ93 91 aa6.71□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 GAGE2BQ13066 116 aa6.71□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM223A0PJW6 202 aa6.7□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SPINK8P0C7L1 97 aa6.7□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.7□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.7□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 A0A1W2PNN7 141 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 F8WDY8 70 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SPAG11BQ08648 103 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 Q6ZVH6 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 HIST1H4GQ99525 98 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.69□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 A6NJY4 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF815PA8K554 130 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 LEPROTO15243 131 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 FXYD2P54710 66 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SFTA2Q6UW10 78 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 Q8IZM0 81 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 COX7B2Q8TF08 81 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.68□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 A0A1B0GWB2 263 aa6.67□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 CXCL5P42830 114 aa6.67□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 CKS1BP61024 79 aa6.67□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 C2orf48Q96LS8 159 aa6.67□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 A0A1W2PPM0 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 GAGE10A6NGK3 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 K7EP34 96 aa6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 C1orf137Q5JT78 98 aa6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 DIRC1Q969H9 104 aa6.66□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 H3BUT2 72 aa6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 J3QQQ9 107 aa6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 NDUFA1O15239 70 aa6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 FABP2P12104 132 aa6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 RNF151Q2KHN1 245 aa6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV7-43P04211 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 KIAA0087Q14695 138 aa6.64□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 RAB37Q96AX2 223 aa6.63□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.62□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 HERV-K104P63124 156 aa6.62□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.62□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 H0Y9J4 135 aa6.61□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.61□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 C10orf25Q5T742 122 aa6.61□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 C2orf82Q6UX34 121 aa6.61□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM238C9JI98 176 aa6.6□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.6□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.6□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0U1RQV1 116 aa6.59□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 K7ERJ3 54 aa6.59□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 TIMM17BO60830 172 aa6.59□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 COX17Q14061 63 aa6.59□□□□□ -1.35
SMIM25-201ENST00000421019 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.58□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 PRR4Q16378 134 aa6.58□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.58□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.58□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0J9YXY3 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.57□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 SPANXCQ9NY87 97 aa6.57□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 ERG28Q9UKR5 140 aa6.57□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0B4J2C4 111 aa6.56□□□□□ -1.36
SMIM25-201ENST00000421019 FAM168BA1KXE4 195 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms