RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 PIPP12273 146 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 FGF7P21781 194 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 S100A3P33764 101 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC48A1Q6P1K1 146 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 COPS9Q8WXC6 57 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC00208Q96KT6 92 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 PROK2Q9HC23 129 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 NINQ8N4C6 2090 aa1.43□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 ABCA4P78363 2273 aa1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 FXYD6P3P58550 94 aa1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 FXYD3Q14802 87 aa1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 PP6455Q8WZ26 134 aa1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCL19Q99731 98 aa1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 RERGLQ9H628 205 aa1.42□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 STAB2Q8WWQ8 2551 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 A6NIN4 97 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 S100A1P23297 94 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPC2P61916 151 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 DCDP81605 110 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 C6orf52Q5T4I8 152 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 XAF1Q6GPH4 301 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q6ZQY7 126 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 C5orf56Q8N8D9 126 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 SERP1Q9Y6X1 66 aa1.41□□□□□ -2.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa1.4□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GWA3 101 aa1.4□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 MCRIP1C9JLW8 97 aa1.4□□□□□ -2.19
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RPS3AP9-201ENST00000417027 FDCSPQ8NFU4 85 aa1.4□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAA60Q9H7X0 242 aa1.4□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 AP4S1Q9Y587 144 aa1.4□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CORTO00230 105 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 IFI6P09912 130 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF56Q15929 161 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 DEFB109BQ30KR1 87 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q56UQ5 140 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPRMQ9NS64 109 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CACNA1CQ13936 2221 aa1.39□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ABCA1O95477 2261 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAH3Q8TD57 4116 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAJC13O75165 2243 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CADP27708 2225 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 S100PP25815 95 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPS27P42677 84 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBM3P98179 157 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CATR1Q13166 79 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 C12orf73Q69YU5 71 aa1.38□□□□□ -2.19
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RPS3AP9-201ENST00000417027 Q6ZS92 163 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTTY10Q9BZA0 68 aa1.38□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1W2PPM0 123 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3BSH0 61 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CBLN1P23435 193 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAV3P56539 151 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 INSL4Q14641 139 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC01590Q5TEZ4 76 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 NDUFA11Q86Y39 141 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa1.37□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 GNGT2O14610 69 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPPP2P59282 170 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC00575Q6W349 94 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q8N8P6 123 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMR3AQ99954 134 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CMC2Q9NRP2 79 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.36□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.35□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa1.35□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 PIN1P1O15428 100 aa1.35□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 GNG4P50150 75 aa1.35□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAH1Q9P2D7 4330 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 MYO7BQ6PIF6 2116 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMIM11AP58511 58 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP3R1P63098 170 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TFF3Q07654 80 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 C10orf128Q5T292 105 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 C20orf197Q8N268 126 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 DSCR8Q96T75 97 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 C12orf57Q99622 126 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 FRAS1Q86XX4 4008 aa1.34□□□□□ -2.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ROS1P08922 2347 aa1.33□□□□□ -2.2
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A087WXM4 84 aa1.33□□□□□ -2.2
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