RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRN-202ENST00000409251 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRN-202ENST00000409251 C1orf195Q5TG92 126 aa8.84□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.84□□□□□ -1
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PTPRN-202ENST00000409251 REG3AQ06141 175 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRN-202ENST00000409251 LINC00575Q6W349 94 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRN-202ENST00000409251 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.82□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.82□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 PSPHP1O15172 72 aa8.82□□□□□ -1
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PTPRN-202ENST00000409251 MUC7Q8TAX7 377 aa8.81□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 Q8IZM0 81 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 DIRC1Q969H9 104 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.79□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 V9GYY9 64 aa8.79□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 X6R8D5 127 aa8.79□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRN-202ENST00000409251 ANK2Q01484 3957 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 TENM2Q9NT68 2774 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP10-11P60412 298 aa8.76□□□□□ -1.01
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