RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 SERP2Q8N6R1 65 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 FAM236CP0DP71 79 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PKP4-201ENST00000389757 Q6ZRP5 223 aa6.97□□□□□ -1.29
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PKP4-201ENST00000389757 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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PKP4-201ENST00000389757 C15orf56Q8N910 161 aa6.82□□□□□ -1.32
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PKP4-201ENST00000389757 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.74□□□□□ -1.33
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