RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 PRCDQ00LT1 54 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SYCE1Q8N0S2 351 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR2T35Q8NGX2 323 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMIM4Q8WVI0 70 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCL13Q99616 98 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCDC77Q9BR77 488 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 C20orf27Q9GZN8 174 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 RNF122Q9H9V4 155 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 NAIPQ13075 1403 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 EFCAB9A8MZ26 197 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARMS2P0C7Q2 107 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 MARCKSL1P49006 195 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 HPCAP84074 193 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 FADDQ13158 208 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCDC58Q4VC31 144 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 LCN9Q8WX39 176 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 TSGA13Q96PP4 275 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARL5CA6NH57 179 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 COPEO14579 308 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM107AO95990 144 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGKCP01834 107 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 RANBP1P43487 201 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 CRIP1P50238 77 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 H3F3AP84243 136 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 C3orf33Q6P1S2 294 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 COMMD7Q86VX2 200 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 TCTE3Q8IZS6 198 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATG5Q9H1Y0 275 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARMC1Q9NVT9 282 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 ERG28Q9UKR5 140 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM218A2RU14 115 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 TNFAIP8O95379 198 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMIM6P0DI80 62 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 CKS1BP61024 79 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 PCBD1P61457 104 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 COX17Q14061 63 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 HIST3H3Q16695 136 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 C1orf54Q8WWF1 131 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 C20orf78Q9BR46 151 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 GINS3Q9BRX5 216 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 NMES1Q9C002 83 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 RBP1P09455 135 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCL2P13500 99 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR10AG1Q8NH19 301 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 STAG3L4Q8TBR4 150 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM203Q969S6 136 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 COPS4Q9BT78 406 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CST11Q9H112 138 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMBIM4Q9HC24 238 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 IFNKQ9P0W0 207 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 A0A1B0GX78 115 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 M0QZ92 97 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 DHFRP00374 187 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 IL5P05113 134 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCKP06307 115 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 FABP4P15090 132 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CXCL2P19875 107 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 NFYBP25208 207 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 HACD4Q5VWC8 232 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR2T2Q6IF00 324 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 TEX47Q8TBZ9 253 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRRC20Q8TCA0 184 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 COX7B2Q8TF08 81 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CIB1Q99828 191 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 LXNQ9BS40 222 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 COMMD3Q9UBI1 195 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 A6NIN4 97 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 C1orf196B1AJZ1 125 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 CETN3O15182 167 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 STX10O60499 249 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 GYPAP02724 150 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 HSD11B1P28845 292 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 EDDM3BP56851 147 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-880P-201ENST00000384526 HIST1H3AP68431 136 aa-2.68□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms