RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 ERVK-7P63135 1459 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SARNPP82979 210 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SBF2Q86WG5 1849 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 RALGAPBQ86X10 1494 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MYOZ3Q8TDC0 251 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 AMELXQ99217 191 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 QRICH2Q9H0J4 1663 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DPH3P1Q9H4G8 78 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 FMN2Q9NZ56 1722 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SHROOM2Q13796 1616 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DIP2AQ14689 1571 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LCE6AA0A183 80 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 F6UZH7 168 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 M0R3E3 92 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 S100A3P33764 101 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TPPP2P59282 170 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 Q6JHZ5 121 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DEFB123Q8N688 67 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 BTAF1O14981 1849 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ITSN1Q15811 1721 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 NALCNQ8IZF0 1738 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 A2ML1A8K2U0 1454 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 I3L2K1 104 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SFT2D2O95562 160 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 APOC3P02656 99 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 S100A1P23297 94 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 COX17Q14061 63 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 WFDC2Q14508 124 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 Q8IZM0 81 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 GNG8Q9UK08 70 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCC5O15440 1437 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SPRR1AP35321 89 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 GNG4P50150 75 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 GNG11P61952 73 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP3R1P63098 170 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 Q5VSD8 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MYOM1P52179 1685 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 MGPP08493 103 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 IGLC1P0CG04 106 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 SVBPQ8N300 66 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM203Q969S6 136 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms