RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361029.8

TRDN-202, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 5

Gene TRDN, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-202ENST00000361029 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 SMCO1Q147U7 214 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 C4orf33Q8N1A6 199 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 SMIM11BQ8TCY0 68 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 BPESC1Q9GZL8 116 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TPT1P8Q9HAU6 139 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 NFAT5O94916 1531 aa0.08□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 COX4I1P13073 169 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 COPZ1P61923 177 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 UBE2G1P62253 170 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 SCIMPQ6UWF3 145 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 DPH3Q96FX2 82 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 PRR15LQ9BU68 103 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TMEM242Q9NWH2 141 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 V9GYV3 84 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 MROH2AA6NES4 1674 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 UBR3Q6ZT12 1888 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 MYO5CQ9NQX4 1742 aa0.07□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 F2Z2F3 143 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 NDUFA2O43678 99 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 IL5P05113 134 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 MT1HP80294 61 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TMEM191AQ9H0A3 160 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa0.06□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 SCN7AQ01118 1682 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 C4AP0C0L4 1744 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TRPM2O94759 1503 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 G3V318 75 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 COX6B1P14854 86 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 EDDM3BP56851 147 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 Q6ZRX8 168 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 WFDC6Q9BQY6 131 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 RPRMQ9NS64 109 aa0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 UACAQ9BZF9 1416 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 CFAP74Q9C0B2 1584 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 USF3Q68DE3 2245 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 NDUFB6O95139 128 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 NMBP08949 121 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 ACYP2P14621 99 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 CBLN1P23435 193 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 S100A12P80511 92 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 RBM3P98179 157 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 INSL4Q14641 139 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 FAM74A4Q5TZK3 123 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 SPTSSAQ969W0 71 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TCEAL4Q96EI5 215 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 PFDN5Q99471 154 aa0.04□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 TMEM14DPA8MWL7 114 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 PIPP12273 146 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 ARPC4P59998 168 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 CCL8P80075 99 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 KCNRGQ8N5I3 272 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 SPTSSBQ8NFR3 76 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 LINC00312Q9Y6C7 94 aa0.03□□□□□ -2.4
TRDN-202ENST00000361029 FYCO1Q9BQS8 1478 aa0.03□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 PIK3C2BO00750 1634 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 LYNX1G3V0Z9 82 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 M0R2T5 61 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 IFNA17P01571 189 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 APODP05090 189 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 MT1HL1P0DM35 61 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 DEFB121Q5J5C9 76 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 Q5VV11 94 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 Q8N8P6 123 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 LINC00470Q9BZP3 86 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 CCDC167Q9P0B6 97 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 IQGAP2Q13576 1575 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 ABCA9Q8IUA7 1624 aa0.02□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 BCORQ6W2J9 1755 aa0.01□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0.01□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 FAM92AA1XBS5 289 aa0.01□□□□□ -2.41
TRDN-202ENST00000361029 K7EP13 123 aa0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 296.3 ms