RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DIRC1Q969H9 104 aa15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.33■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.33■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRYO14603 147 aa15.33■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 REG3AQ06141 175 aa15.33■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C10orf25Q5T742 122 aa15.33■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRO0255Q9UI72 69 aa15.32■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0J9YWU9 116 aa15.32■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.32■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A096LPF7 62 aa15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ESRGQ1W209 222 aa15.3■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZTC4 211 aa15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPLKIPQ8TAP9 179 aa15.29■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGKV4-1P06312 121 aa15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 V9GYY9 64 aa15.28■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV1-51P01701 117 aa15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKAP9Q99996 3911 aa15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JMJD1CQ15652 2540 aa15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q8N9L7 120 aa15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEC61GP60059 68 aa15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CELA1Q9UNI1 258 aa15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIGD2AQ9BW72 106 aa15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 X6R8D5 127 aa15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 hDV103S1A0JD37 113 aa15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.11■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.1■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.1■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CUBNO60494 3623 aa15.09■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPREB1P12018 145 aa15.09■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZRU5 148 aa15.01□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMIM29Q86T20 159 aa15.01□□□□□ -0.01
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPN13Q12923 2485 aa15□□□□□ -0.01
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf64Q8NEQ6 169 aa14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A1B0GW54 56 aa14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRK2Q5S007 2527 aa14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.96□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.95□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PMAIP1Q13794 54 aa14.95□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAMK2N2Q96S95 79 aa14.95□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.94□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB4AO15263 64 aa14.94□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP10-9P60411 292 aa14.93□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 J3QKU1 62 aa14.93□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APCP25054 2843 aa14.92□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q8N377 158 aa14.91□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TENM4Q6N022 2769 aa14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.89□□□□□ -0.03
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