RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.02□□□□□ -1.28
PDPR-201ENST00000288050 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.02□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.02□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 Q96NJ1 140 aa7.02□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.02□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 JMJD1CQ15652 2540 aa7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 CNFNQ9BYD5 112 aa7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 PRR9Q5T870 116 aa7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.01□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 Q8NBF4 154 aa7□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 FAM229AH3BQW9 127 aa7□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 CDIP1Q9H305 208 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 A8MUN3 132 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 A0A1B0GUV1 79 aa6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.98□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 C22orf24Q9Y442 160 aa6.98□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 LINC01006Q8NI28 216 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 PRO3102Q9H379 93 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 PRR15Q8IV56 129 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 AMELXQ99217 191 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 IGLV6-57P01721 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PDPR-201ENST00000288050 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.96□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 BRI3O95415 125 aa6.96□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 CDSNQ15517 529 aa6.96□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.95□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 H3BS24 57 aa6.95□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 GAS8-AS1O95177 125 aa6.95□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 POLQO75417 2590 aa6.95□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 A0A0D9SG42 100 aa6.95□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.94□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 Q6ZRU5 148 aa6.93□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 Q1T7F1 81 aa6.93□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 MTORP42345 2549 aa6.93□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 A8MWP4 228 aa6.92□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 J3QL48 77 aa6.92□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.92□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.91□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 KRTAP10-9P60411 292 aa6.91□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDPR-201ENST00000288050 Q6ZRX8 168 aa6.9□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 ZNF580Q9UK33 172 aa6.89□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 IGLV1-40P01703 118 aa6.89□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 Q6ZRP5 223 aa6.88□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 CENPFP49454 3210 aa6.88□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 PCSK5Q92824 1860 aa6.87□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.87□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 LINC00167Q96N53 147 aa6.87□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 CHTF8P0CG12 524 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 K7EQZ3 153 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 Q6ZPA2 131 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.86□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.85□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.85□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.85□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 WIPF1O43516 503 aa6.85□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.85□□□□□ -1.31
PDPR-201ENST00000288050 CR1P17927 2039 aa6.84□□□□□ -1.31
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PDPR-201ENST00000288050 IGLV1-51P01701 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 ZNF575Q86XF7 245 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDPR-201ENST00000288050 C16orf90A8MZG2 172 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 FAM104AQ969W3 186 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 RTL8CO15255 209 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDPR-201ENST00000288050 FHL3Q13643 280 aa6.78□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 LINC00310P59036 64 aa6.78□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.78□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 Q6ZSN1 163 aa6.78□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 DMAC1Q96GE9 116 aa6.77□□□□□ -1.32
PDPR-201ENST00000288050 DSCR10P59022 87 aa6.77□□□□□ -1.33
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