RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.44□□□□□ -1.22
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GGPS1-201ENST00000282841 LITAFQ99732 161 aa7.43□□□□□ -1.22
GGPS1-201ENST00000282841 B9D2Q9BPU9 175 aa7.43□□□□□ -1.22
GGPS1-201ENST00000282841 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.43□□□□□ -1.22
GGPS1-201ENST00000282841 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.42□□□□□ -1.22
GGPS1-201ENST00000282841 COX7B2Q8TF08 81 aa7.42□□□□□ -1.22
GGPS1-201ENST00000282841 A0A087WZ39 114 aa7.42□□□□□ -1.22
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GGPS1-201ENST00000282841 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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