RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 OXTP01178 125 aa6.76□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.76□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 REG3AQ06141 175 aa6.76□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.76□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 J3KT08 172 aa6.75□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 GHRHP01286 108 aa6.74□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 HTN3P15516 51 aa6.74□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.74□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.74□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.74□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 CELA1Q9UNI1 258 aa6.74□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.73□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 NDUFC2O95298 119 aa6.73□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.73□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 LINC00575Q6W349 94 aa6.73□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 SPAG11BQ08648 103 aa6.72□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 DAD1P61803 113 aa6.71□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 DPH3Q96FX2 82 aa6.71□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.71□□□□□ -1.33
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZQT0 140 aa6.71□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.71□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 ANK2Q01484 3957 aa6.71□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.7□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 COX17Q14061 63 aa6.7□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZQY7 126 aa6.7□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.7□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM258P61165 79 aa6.7□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 UBL5Q9BZL1 73 aa6.7□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 LYRM9A8MSI8 78 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 C20orf197Q8N268 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 KLK12Q9UKR0 248 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 SCXQ7RTU7 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 APOC4P55056 127 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 HAMPP81172 84 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 Q8NAQ8 132 aa6.68□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 IGLV6-57P01721 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZVQ6 151 aa6.67□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.66□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.66□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 F8P00451 2351 aa6.66□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.66□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHRNA6-201ENST00000276410 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.65□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 C4orf26Q17RF5 130 aa6.65□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 RETNQ9HD89 108 aa6.65□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 A0A0J9YWU9 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 STAB1Q9NY15 2570 aa6.64□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.64□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 MIFP14174 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 SNURFQ9Y675 71 aa6.64□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.63□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 MUC7Q8TAX7 377 aa6.63□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 TENM3Q9P273 2699 aa6.63□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 LELP1Q5T871 98 aa6.62□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 Q5XG85 94 aa6.62□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 DIRC1Q969H9 104 aa6.62□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 PRR34Q9NV39 138 aa6.62□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 MAST4O15021 2626 aa6.61□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.61□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 Q8N9L7 120 aa6.61□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 RMI2Q96E14 147 aa6.61□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 H7BZZ5 65 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 COX7BP24311 80 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 C5orf47Q569G3 176 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 NOTCH1P46531 2555 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM236CP0DP71 79 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 VPREB1P12018 145 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA6-201ENST00000276410 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZRU5 148 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 KRTAP10-11P60412 298 aa6.57□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZTC4 211 aa6.57□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 F8WEM9 126 aa6.56□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 C15orf56Q8N910 161 aa6.56□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.55□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 CXCL6P80162 114 aa6.55□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.55□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 BPY2O14599 106 aa6.54□□□□□ -1.36
CHRNA6-201ENST00000276410 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.54□□□□□ -1.36
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