RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.6□□□□□ -1.19
CNGA3-201ENST00000272602 RMI2Q96E14 147 aa7.59□□□□□ -1.19
CNGA3-201ENST00000272602 Q5XG85 94 aa7.59□□□□□ -1.19
CNGA3-201ENST00000272602 BRK1Q8WUW1 75 aa7.59□□□□□ -1.19
CNGA3-201ENST00000272602 A8MTW9 85 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 C6orf99Q4VX62 202 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 F8WEM9 126 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 FSHBP01225 129 aa7.58□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.57□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.57□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.57□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 Q8N814 137 aa7.55□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 TENM2Q9NT68 2774 aa7.55□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.55□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 WIPF1O43516 503 aa7.55□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.54□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.54□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.54□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 DAD1P61803 113 aa7.54□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 SS18Q15532 418 aa7.54□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 TENM3Q9P273 2699 aa7.53□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.53□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.53□□□□□ -1.2
CNGA3-201ENST00000272602 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.52□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.52□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.52□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 PRO0628Q9UI54 55 aa7.52□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 H7BZZ5 65 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 M0R2N4 97 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 Q8N3U1 123 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 A0A087WZ39 114 aa7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 Q6ZQY7 126 aa7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.49□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 Q6ZVQ6 151 aa7.49□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 GYPEP15421 78 aa7.48□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 AKAP9Q99996 3911 aa7.48□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 Q8N9L7 120 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.46□□□□□ -1.21
CNGA3-201ENST00000272602 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.46□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 MIFP14174 115 aa7.45□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV1-51P01701 117 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 Q6ZQT0 140 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 C16orf74Q96GX8 76 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 NREPQ16612 68 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00575Q6W349 94 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 C16orf95Q9H693 158 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf195Q5TG92 126 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 Q8IZM0 81 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 C6orf223Q8N319 242 aa7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP10-11P60412 298 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 KLKP1Q107X0 134 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 BPY2O14599 106 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-201ENST00000272602 V9GYY9 64 aa7.4□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0J9YWU9 116 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 C3orf84H3BNL1 204 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 APOC4P55056 127 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 SPAG11BQ08648 103 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 MUC7Q8TAX7 377 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 CELA1Q9UNI1 258 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 C10orf25Q5T742 122 aa7.38□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 REG3AQ06141 175 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 PRR4Q16378 134 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 DIRC1Q969H9 104 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFC1O43677 76 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 Q8NDZ9 215 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.36□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.36□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00167Q96N53 147 aa7.36□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 PDE6GP18545 87 aa7.35□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.35□□□□□ -1.23
CNGA3-201ENST00000272602 IL17DQ8TAD2 202 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms