RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-3P60369 221 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZVQ6 151 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 C14orf177Q52M58 125 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 C10orf25Q5T742 122 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 LINC01556Q5JQF7 62 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GW54 56 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 PRYO14603 147 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 FRYLO94915 3013 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZRU5 148 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZTC4 211 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 PRR4Q16378 134 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 Q8N3U1 123 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 RETNQ9HD89 108 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.96□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 VPREB1P12018 145 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 C1orf195Q5TG92 126 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 ESRGQ1W209 222 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 C3orf84H3BNL1 204 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 NDUFB1O75438 58 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 JMJD1CQ15652 2540 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 A0A096LNI7 61 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 H0Y9J4 135 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 C22orf24Q9Y442 160 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 WIPF1O43516 503 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 C7orf33Q8WU49 177 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 UBE2AP49459 152 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 C1orf137Q5JT78 98 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 REG3GQ6UW15 175 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 B9D2Q9BPU9 175 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-201ENST00000264345 FRYQ5TBA9 3013 aa5.9□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.9□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.9□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.9□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 C15orf56Q8N910 161 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 POLQO75417 2590 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 ERC2-IT1O76042 136 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 LRRK2Q5S007 2527 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 IGKV4-1P06312 121 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZRX8 168 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 A6NED7 52 aa5.87□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZRP5 223 aa5.87□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.87□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 PMAIP1Q13794 54 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-11P60412 298 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 Q8NBF4 154 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 ZZEF1O43149 2961 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 KLKP1Q107X0 134 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 PSPHP1O15172 72 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 C4orf26Q17RF5 130 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 F8P00451 2351 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 Q8NDZ9 215 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 LRBAP50851 2863 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 HCG22E2RYF7 251 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 Q9BRP9 147 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 C16orf90A8MZG2 172 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 Q8N377 158 aa5.79□□□□□ -1.48
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