RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.76□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.76□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZUT4 128 aa9.76□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 M0R143 59 aa9.75□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2D1P51668 147 aa9.75□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 COX7A2LO14548 114 aa9.74□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 CTAG1AP78358 180 aa9.74□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 AMELXQ99217 191 aa9.74□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf86A6NJI1 115 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 DLEU1O43261 78 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN13O95857 204 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 FAM104AQ969W3 186 aa9.73□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.72□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 MALP21145 153 aa9.72□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 SEC11AP67812 179 aa9.72□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.72□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 E9PLD3 99 aa9.71□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 APOMO95445 188 aa9.71□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE2BQ13066 116 aa9.71□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf38Q86SI9 138 aa9.71□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf48Q96LS8 159 aa9.7□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.7□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.69□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG11BQ08648 103 aa9.69□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 H3BRM9 83 aa9.68□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 BATFQ16520 125 aa9.68□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.68□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 PCP2Q8IVA1 136 aa9.68□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 CDIP1Q9H305 208 aa9.68□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.67□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 TPRXLQ17RH7 258 aa9.67□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.67□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 HERVK_113P63121 156 aa9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 HIGD1BQ9P298 99 aa9.66□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM223A0PJW6 202 aa9.65□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 LEPROTO15243 131 aa9.65□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 RNF151Q2KHN1 245 aa9.65□□□□□ -0.86
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF815PA8K554 130 aa9.64□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.64□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HSD52Q0P140 79 aa9.63□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.63□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.63□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.63□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.63□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.63□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WZ39 114 aa9.62□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.62□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 J3QQQ9 107 aa9.62□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf25Q5T742 122 aa9.62□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.61□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.61□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.6□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 F8WDY8 70 aa9.6□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.6□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TAL2Q16559 108 aa9.6□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.6□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.6□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 FAM168BA1KXE4 195 aa9.59□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA1O15239 70 aa9.59□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.59□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.59□□□□□ -0.87
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK8P0C7L1 97 aa9.58□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0087Q14695 138 aa9.58□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.58□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H4GQ99525 98 aa9.58□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.58□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 A6NDN8 102 aa9.57□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 CRYGAP11844 174 aa9.57□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.57□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087X002 238 aa9.55□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.55□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 CEND1Q8N111 149 aa9.54□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.54□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.53□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE2EQ4V326 116 aa9.53□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.53□□□□□ -0.88
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.52□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM238C9JI98 176 aa9.52□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf82Q6UX34 121 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.4 ms