RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635919.1

CREBBP-216, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-216ENST00000635919 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.05□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.05□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 EYSQ5T1H1 3165 aa4.05□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 ZZEF1O43149 2961 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 IGKV2D-28P01615 120 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 FAM236CP0DP71 79 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 COX6A2Q02221 97 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 UBL5Q9BZL1 73 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 ZNF702PQ9H963 129 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 SPTBN2O15020 2390 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 NACAE9PAV3 2078 aa4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 DEFB131AP59861 70 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 Q8IZM0 81 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 TMEM86BQ8N661 226 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 LINC00846Q9NV44 126 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.03□□□□□ -1.76
CREBBP-216ENST00000635919 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 KNCNA6PVL3 124 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 CCL18P55774 89 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 KLKP1Q107X0 134 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 LY6EQ16553 131 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 Q5XG85 94 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.02□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 UBE2L6O14933 153 aa4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 ERC2-IT1O76042 136 aa4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 SS18Q15532 418 aa4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 C16orf74Q96GX8 76 aa4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 DMDP11532 3685 aa4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 PFN2P35080 140 aa4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 C1orf158Q8N1D5 194 aa4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 C3orf56Q8N813 242 aa4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 CCL19Q99731 98 aa4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 A0A096LNT2 108 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 A0A1B0GW54 56 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 LECT2O14960 151 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 XCL1P47992 114 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 C6orf223Q8N319 242 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 Q8N814 137 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 XCL2Q9UBD3 114 aa3.99□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 BSNQ9UPA5 3926 aa3.98□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.98□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.98□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 LINC00158P58513 81 aa3.98□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.98□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 DSCR8Q96T75 97 aa3.98□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 ZNF292O60281 2723 aa3.97□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.97□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.97□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.97□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.97□□□□□ -1.77
CREBBP-216ENST00000635919 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 H7BZZ5 65 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 C4orf26Q17RF5 130 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 Q6ZQT0 140 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.787e-8■■■□□ 16.4
CREBBP-216ENST00000635919 SPTA1P02549 2419 aa3.96□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 COL6A3P12111 3177 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 NCR3O14931 201 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 LINC00575Q6W349 94 aa3.95□□□□□ -1.78
CREBBP-216ENST00000635919 C20orf197Q8N268 126 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms