RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM229AH3BQW9 127 aa7.01□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.01□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV1-40P01703 118 aa7.01□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 J3QL48 77 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 VPREB1P12018 145 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 KLKP1Q107X0 134 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 ERC2-IT1O76042 136 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 PRLHP81277 87 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 ADAMTS20P59510 1910 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 PRR15Q8IV56 129 aa6.98□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.98□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 IGKV2-30P06310 120 aa6.98□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 H0Y9P7 68 aa6.98□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 H7BZZ5 65 aa6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 AGRNO00468 2067 aa6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 HCG22E2RYF7 251 aa6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00315P59091 139 aa6.97□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 C16orf95Q9H693 158 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 KRTAP10-9P60411 292 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00575Q6W349 94 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A087WSZ3 146 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.95□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 MDFIQ99750 246 aa6.95□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 hDV103S1A0JD37 113 aa6.95□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV1-51P01701 117 aa6.95□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 C10orf142B7Z368 130 aa6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZQT0 140 aa6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.93□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 NBASA2RRP1 2371 aa6.93□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 AVPP01185 164 aa6.93□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.92□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.92□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-228ENST00000635853 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.9□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 CREBBPQ92793 2442 aa6.9□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 C16orf90A8MZG2 172 aa6.89□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.89□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 SMIM29Q86T20 159 aa6.89□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.89□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 C22orf24Q9Y442 160 aa6.88□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 CDSNQ15517 529 aa6.88□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 MOBPQ13875 183 aa6.88□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZRU5 148 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZSN1 163 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 CACNA1HO95180 2353 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 MED13Q9UHV7 2174 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1B0GU69 56 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 PTPRBP23467 1997 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 ABCA1O95477 2261 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.84□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.84□□□□□ -1.31
SPTAN1-228ENST00000635853 A8MUN3 132 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 RTL8CO15255 209 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 HIVEP2P31629 2446 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 TNCP24821 2201 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 ROS1P08922 2347 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 ACYP2P14621 99 aa6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 Q9UF83 564 aa6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1B0GUV1 79 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 OXTP01178 125 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 LCA10Q71F78 164 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 DSCAMO60469 2012 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1B0GW54 56 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 Q1T7F1 81 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 NOTCH2Q04721 2471 aa6.8□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 A8MTW9 85 aa6.8□□□□□ -1.32
SPTAN1-228ENST00000635853 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.324e-7■■■■□ 21.7
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