RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635614.1

CD55-211, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 5

Gene CD55, Length 1,145 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-211ENST00000635614 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 HERVK_113P63121 156 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 RHEBQ15382 184 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 TIMM17AQ99595 171 aa6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CD55-211ENST00000635614 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 UBE2D1P51668 147 aa6.52□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 REG3GQ6UW15 175 aa6.52□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 AMELXQ99217 191 aa6.52□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 IGIPA6NJ69 53 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 CKS1BP61024 79 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 IFITM2Q01629 132 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 NDUFA5Q16718 116 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 C10orf25Q5T742 122 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 ERASQ7Z444 233 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 COMMD7Q86VX2 200 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 FAM104AQ969W3 186 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 TOMM6Q96B49 74 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.51□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 ADCYAP1P18509 176 aa6.5□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.5□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.5□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 CXCL5P42830 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 FA2HQ7L5A8 372 aa6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 Q8IZM0 81 aa6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.48□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.48□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.48□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 MYCBP2O75592 4640 aa6.47□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 LINC01546A6NGU7 62 aa6.47□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 SNAPINO95295 136 aa6.47□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 RAB5BP61020 215 aa6.47□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 KIAA0087Q14695 138 aa6.47□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.47□□□□□ -1.37
CD55-211ENST00000635614 A0A0J9YXV3 536 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 A0A1W2PNN7 141 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 GAGE2EQ4V326 116 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 SVBPQ8N300 66 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 LINC01600Q96MT4 127 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.46□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.45□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 F8VRH5 84 aa6.45□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 H3BRM9 83 aa6.45□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 PMVKQ15126 192 aa6.45□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.45□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 C1orf137Q5JT78 98 aa6.44□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.44□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 APOC3P02656 99 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 LINC00614P0C842 121 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 UBE2BP63146 152 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 C2orf82Q6UX34 121 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 DIRC1Q969H9 104 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 CST9LQ9H4G1 147 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.43□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.42□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 SFTA2Q6UW10 78 aa6.42□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.41□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 M0QXV9 152 aa6.41□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 ATP5LO75964 103 aa6.41□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 HBDP02042 147 aa6.41□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 COX7B2Q8TF08 81 aa6.41□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 NUPR1O60356 82 aa6.4□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 IGLV7-43P04211 117 aa6.4□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 MT1HL1P0DM35 61 aa6.4□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.4□□□□□ -1.38
CD55-211ENST00000635614 HERC1Q15751 4861 aa6.39□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.39□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 NDUFA6P56556 154 aa6.39□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.39□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.38□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 FAM168BA1KXE4 195 aa6.38□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 IGLC3P0DOY3 106 aa6.37□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 COX17Q14061 63 aa6.37□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CD55-211ENST00000635614 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms